国家“863计划”现代农业技术领域通过攻关精细定位和克隆一批重要性状的有利基因，开发一批功能标记，奠定了开展分子标记育种的技术基础。

　　在水稻上，成功开发控制稻米品质形成的淀粉合成相关酶基因分子标记35对，精细定位和图位克隆水稻籽粒宽度基因GW5、显性矮秆基因（dx）、水稻穗部性状突变体ap、水稻花粉隐性核不育基因ms～nop、香味基因和红莲型恢复基因Rf6（t）；获得水稻白化基因共分离SSR标记3个，第4染色体上白背飞虱拒食抗性基因qSI～4的分子标记M3013和M6603、第6染色体上白背飞虱杀卵抗性基因qOVI～6的特异分子标记M2324和M2529、第3和第6染色体上大粒基因（GW3,GW6）的特异标记RM282、RM6836、第2染色体上少蘖基因（ft）的分子标记RM6874和RM5764等。