国家“863计划”现代农业技术领域在动植物品种分子设计方面，鉴定出一批与产量、品质、抗病等性状相关的重要功能基因；发现并初步阐明了多个调控动植物重要性状遗传网络的代谢途径，；采用分子标记选择技术与常规育种技术相结合，培育了一批水稻、小麦、大豆的优良新品种；研究并阐明了我国地方品种猪瘦肉率低于引进品种的发育调控途径；初步完成了水稻、油菜、棉花和中国地方鸡种分子设计生物信息数据库的建设，为构筑适合我国动植物品种分子设计的技术体系，大幅度提升育种效率和技术水平奠定了基础。

　　审定水稻、小麦、大豆新品种（组合）50个，获得新品种保护权6项，累计推广1858万亩；发表学术论文362篇，其中，SCI收录论文129篇，发表论著7部；标记定位了40余个不同类型的优质、抗病、抗虫、抗逆（干旱、盐碱、低温等）及产量相关基因，获得各类分子标记500余个。